Biologi Regnemaskiner

Komplement, revers komplement, GC% og basesammensætning for en DNA-sekvens.

Transkriber DNA til RNA og find basesammensætningen.

Estimer proteinets MW fra antal rester (gns. 110 Da/rest).

Aminosyresammensætning og antal for en proteinsekvens.

Opdel en DNA/RNA-sekvens i kodoner og kontroller læserammens fuldstændighed.

Genotypeforhold for en monohybrid krydsning fra to forældregenotyper.

Klassisk Punnett-kvadrat-krydsning for et enkelt gen.

Hardy-Weinberg allel- og genotypefrekvenser fra q.

Hardy-Weinberg genotypefrekvenser fra allelfrekvensen p.

Frekvens af dominant versus recessiv fænotype under Hardy-Weinberg.

Ligevægtsopdeling p²+2pq+q²=1 fra allelfrekvens.

Eksponentiel populationsvækst N(t) = N0*e^(rt).

Populationsvækst med en bæreevne K.

Ubegrænset eksponentiel vækst N(t) = N0*e^(rt).

Fordoblingstid fra væksthastigheden: ln(2)/r.

Bakteriel generationstid fra populationsændring over tid.

Hæmocytometer celletælling: celler/mL fra optælling og fortynding.

Cellekoncentration fra det samlede antal og volumen.

Procentvis vitalitet fra levende og døde celletællinger.

PCR-produktamplifikation: kopier = start x (1+E)^cykler.

Relativ qPCR fold-change fra Ct-værdier og effektivitet.

GC% = (G+C) / samlet antal baser x 100 for en DNA-sekvens.

Wallace-reglens Tm for korte primere/sekvenser.

Wallace-reglens primer Tm = 2(A+T) + 4(G+C), for primere < 14 nt.

Molekylvægt for dsDNA = bp x 650 g/mol/bp.

Molekylvægt for RNA = nt x 320,5 + 159 g/mol.

Konverter DNA-koncentration i ng/uL og MW til nM.

Konverter RNA-koncentration i ng/uL og MW til nM.

Antal DNA-molekyler fra masse og fragmentlængde.

Antal plasmidmolekyler fra masse og plasmidlængde.

TE (cfu/ug) fra kolonier, DNA-masse og udpladet fraktion.