Biologie Rekenmachines

Complement, omgekeerd complement, GC% en basensamenstelling van een DNA-sequentie.

Transcribeer DNA naar RNA en bepaal de basensamenstelling.

Schat het MW van een eiwit op basis van het aantal residuen (gem. 110 Da/residu).

Aminozuursamenstelling en aantallen voor een eiwitsequentie.

Splits een DNA/RNA-sequentie in codons en controleer de leesraamvolledigheid.

Genotypeverhoudingen van een monohybride kruising uit twee oudergenotypen.

Klassieke Punnett-vierkant kruising voor één gen.

Hardy-Weinberg allel- en genotypefrequenties op basis van q.

Hardy-Weinberg genotypefrequenties op basis van allelfrequentie p.

Frequentie van dominant versus recessief fenotype volgens Hardy-Weinberg.

Evenwichtsuitsplitsing p²+2pq+q²=1 op basis van allelfrequentie.

Exponentiële populatiegroei N(t) = N0*e^(rt).

Populatiegroei met een draagkracht K.

Onbeperkte exponentiële groei N(t) = N0*e^(rt).

Verdubbelingstijd op basis van de groeisnelheid: ln(2)/r.

Bacteriële generatietijd op basis van populatieverandering in de tijd.

Hemocytometer celtelling: cellen/mL uit telling en verdunning.

Celconcentratie op basis van totaal aantal en volume.

Percentage viabiliteit uit levende en dode celaantallen.

PCR-productamplificatie: kopieën = start x (1+E)^cycli.

Relatieve qPCR fold-change uit Ct-waarden en efficiëntie.

GC% = (G+C) / totaal aantal basen x 100 voor een DNA-sequentie.

Wallace-regel Tm voor korte primers/sequenties.

Wallace-regel primer Tm = 2(A+T) + 4(G+C), voor primers < 14 nt.

Moleculair gewicht van dsDNA = bp x 650 g/mol/bp.

Moleculair gewicht van RNA = nt x 320,5 + 159 g/mol.

Zet DNA-concentratie in ng/uL en MW om naar nM.

Zet RNA-concentratie in ng/uL en MW om naar nM.

Aantal DNA-moleculen op basis van massa en fragmentlengte.

Aantal plasmidemoleculen op basis van massa en plasmidelengte.

TE (cfu/ug) op basis van kolonies, DNA-massa en uitgeplateerde fractie.