Biologi Kalkylatorer

Komplement, omvänt komplement, GC% och baskomposition för en DNA-sekvens.

Transkribera DNA till RNA och få baskompositionen.

Uppskatta proteinets MW från antal aminosyror (medel 110 Da/aminosyra).

Aminosyrasammansättning och antal för en proteinsekvens.

Dela upp en DNA/RNA-sekvens i kodoner och kontrollera ramens fullständighet.

Genotypförhållanden för en monohybrid korsning från två föräldragenotyper.

Klassisk Punnett-ruta-korsning för en enskild gen.

Hardy-Weinberg allel- och genotypfrekvenser utifrån q.

Hardy-Weinberg genotypfrekvenser utifrån allelfrekvensen p.

Frekvens av dominant kontra recessiv fenotyp enligt Hardy-Weinberg.

Jämviktsuppdelning p²+2pq+q²=1 utifrån allelfrekvens.

Exponentiell populationstillväxt N(t) = N0*e^(rt).

Populationstillväxt med en bärkapacitet K.

Obegränsad exponentiell tillväxt N(t) = N0*e^(rt).

Fördubblingstid från tillväxttakten: ln(2)/r.

Bakteriell generationstid från populationsförändring över tid.

Hemocytometer-cellräkning: celler/mL från antal och spädning.

Cellkoncentration från totalt antal och volym.

Procentuell viabilitet från levande och döda cellräkningar.

PCR-produktamplifiering: kopior = ursprung x (1+E)^cykler.

Relativ qPCR fold-change från Ct-värden och effektivitet.

GC% = (G+C) / totalt antal baser x 100 för en DNA-sekvens.

Wallace-regelns Tm för korta primrar/sekvenser.

Wallace-regelns primer Tm = 2(A+T) + 4(G+C), för primrar < 14 nt.

Molekylvikt för dsDNA = bp x 650 g/mol/bp.

Molekylvikt för RNA = nt x 320,5 + 159 g/mol.

Omvandla DNA-koncentration i ng/uL och MW till nM.

Omvandla RNA-koncentration i ng/uL och MW till nM.

Antal DNA-molekyler från massa och fragmentlängd.

Antal plasmidmolekyler från massa och plasmidlängd.

TE (cfu/ug) från kolonier, DNA-massa och utplattad fraktion.