ביולוגיה מחשבונים

משלים, משלים הפוך, אחוז GC והרכב בסיסים של רצף DNA.

שכפל DNA ל-RNA וקבל את הרכב הבסיסים.

הערך את המשקל המולקולרי של חלבון ממספר השאריות (ממוצע 110 Da/שארית).

הרכב וספירת חומצות אמינו ברצף חלבון.

פצל רצף DNA/RNA לקודונים ובדוק את שלמות מסגרת הקריאה.

יחסי גנוטיפ בהצלבה מונוהיברידית משני גנוטיפים הוריים.

הצלבת ריבוע פונט קלאסית לגן בודד.

תדירויות אללים וגנוטיפים לפי הרדי-ויינברג מתוך q.

תדירויות גנוטיפים לפי הרדי-ויינברג מתוך תדירות האלל p.

תדירות פנוטיפ דומיננטי לעומת רצסיבי לפי הרדי-ויינברג.

פירוק שיווי המשקל p²+2pq+q²=1 מתוך תדירות האלל.

גידול אוכלוסייה מעריכי N(t) = N0*e^(rt).

גידול אוכלוסייה עם קיבולת נשיאה K.

גידול מעריכי בלתי מוגבל N(t) = N0*e^(rt).

זמן הכפלה מקצב הגידול: ln(2)/r.

זמן דור חיידקי משינוי האוכלוסייה במשך הזמן.

ספירת תאים בהמוציטומטר: תאים/מ"ל מספירה ומדילול.

ריכוז תאים ממספר כולל ונפח.

אחוז חיוניות מספירת תאים חיים ומתים.

הגברת תוצר PCR: עותקים = התחלה x (1+E)^מחזורים.

שינוי קיפול יחסי ב-qPCR מערכי Ct ויעילות.

אחוז GC = (G+C) / סך הבסיסים x 100 לרצף DNA.

Tm לפי כלל וואלאס לפריימרים/רצפים קצרים.

Tm של פריימר לפי כלל וואלאס = 2(A+T) + 4(G+C), לפריימרים קצרים מ-14 nt.

משקל מולקולרי של DNA דו-גדילי = bp x 650 g/mol/bp.

משקל מולקולרי של RNA = nt x 320.5 + 159 g/mol.

המר ריכוז DNA ב-ng/uL ומשקל מולקולרי ל-nM.

המר ריכוז RNA ב-ng/uL ומשקל מולקולרי ל-nM.

מספר מולקולות DNA ממסה ומאורך הקטע.

מספר מולקולות פלסמיד ממסה ומאורך הפלסמיד.

TE (cfu/ug) ממספר קולוניות, מסת DNA ושיעור המרוח.